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新軟件用DNA創(chuàng)建3D納米結(jié)構(gòu) 可制造運(yùn)送藥物的微型容器

發(fā)布時(shí)間:2022-12-28 10:48:00來源: 科技日?qǐng)?bào)

  科技日?qǐng)?bào)北京12月27日電 (記者張夢(mèng)然)據(jù)最新一期《科學(xué)進(jìn)展》雜志報(bào)道,美國杜克大學(xué)和亞利桑那州立大學(xué)研究人員新開發(fā)的開源軟件程序可讓用戶繪制圓形的圖紙或數(shù)字模型,并將它們轉(zhuǎn)化為由DNA構(gòu)成的3D結(jié)構(gòu),每個(gè)3D結(jié)構(gòu)就是一個(gè)微小的空心體,其直徑不超過百萬分之五厘米,一根針頭上可容納超過50000個(gè)這樣的微結(jié)構(gòu)。

  研究人員表示,這些不僅僅是納米雕塑。該軟件可讓研究人員制造微型容器來運(yùn)送藥物,或制造用于鑄造具有特定形狀的金屬納米顆粒的模具,用于太陽能電池、醫(yī)學(xué)成像等。

  對(duì)大多數(shù)人來說,DNA是生命的藍(lán)圖,所有生物的遺傳指令。但對(duì)于新研究來說,DNA不僅僅是遺傳信息的載體,它還是源代碼和構(gòu)建材料。

  DNA的遺傳密碼中有四個(gè)“字母”或堿基,它們?cè)诩?xì)胞中以可預(yù)測(cè)的方式配對(duì),形成DNA階梯的梯級(jí)。研究人員采用了DNA的這些嚴(yán)格的堿基配對(duì)特性——A與T,C與G,通過設(shè)計(jì)具有特定序列的DNA鏈,他們可對(duì)這些鏈進(jìn)行“編程”,將它們拼湊成不同的形狀。

  該方法包括在數(shù)百條短DNA鏈的幫助下折疊一條或幾條數(shù)千個(gè)堿基長的單鏈DNA,這些短DNA鏈與長鏈上的互補(bǔ)序列結(jié)合并將它們“固定”到位。

  研究人員開發(fā)了軟件DNAxiS,其工作原理是將一條長長的DNA雙螺旋盤繞成同心環(huán),這些同心環(huán)相互堆疊以形成物體的輪廓,就像使用黏土圈來制作鍋一樣。為了使結(jié)構(gòu)更堅(jiān)固,該團(tuán)隊(duì)還可以用額外的層來加固它們以提高穩(wěn)定性。

  研究團(tuán)隊(duì)展示了他們可制作的各種形狀:圓錐形、葫蘆形、三葉草形。DNAxiS是第一個(gè)允許用戶自動(dòng)設(shè)計(jì)此類形狀的軟件工具,它使用算法來確定放置短DNA“訂書釘”的位置,以將較長的DNA環(huán)連接在一起并將形狀固定到位。

  例如,給定一個(gè)蘑菇形狀的模型,計(jì)算機(jī)會(huì)吐出一系列DNA鏈,這些鏈會(huì)自組裝成正確的結(jié)構(gòu)。一旦在試管中合成并混合了鏈,其余部分就會(huì)自行處理:通過加熱和冷卻DNA混合物,在短短12小時(shí)內(nèi)就能神奇地折疊成DNA納米結(jié)構(gòu)。

  研究人員表示,他們的DNA設(shè)計(jì)軟件在新型三維結(jié)構(gòu)的自動(dòng)化設(shè)計(jì)方面向前邁出了一大步。

  總編輯圈點(diǎn)

  DNA,我們最為熟悉的生物大分子,不僅攜帶了大量生物學(xué)信息,如今,還可以作為納米結(jié)構(gòu)和納米器件的重要組成構(gòu)件——這也是近些年來圍繞DNA研究形成的新熱點(diǎn)。DNA成為一種自組裝的材料,能像紙張一樣被折疊,建造出所需的3D納米結(jié)構(gòu)。本文介紹了一種新開發(fā)的開源軟件程序,用戶可以自行設(shè)計(jì)各種形狀,比如蘑菇形、葫蘆形。軟件此刻化身“神筆馬良”,將設(shè)計(jì)圖變成施工圖,幫助進(jìn)行DNA的建構(gòu)。這樣一來,用DNA創(chuàng)建3D納米結(jié)構(gòu)的門檻也可以大為降低。

(責(zé)編:陳濛濛)

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